Cuando un equipo de salvamento entra en la Leviatán —una nave que lleva años a la deriva por el espacio—, se encuentra con el diario raído de un joven llamado Kazuma, en el que este relata que, en algún lugar de la nave, todavía se halla un superviviente de la catástrofe que tuvo lugar en su interior. Al leerlo, los miembros del equipo descubren que, años atrás, en un viaje escolar a la Tierra, Kazuma y sus compañeros de clase se quedaron atrapados en la nave tras una explosión en el casco. Junto con su amigo Futaba, Kazuma escucha a hurtadillas una conversación del profesor en la que confiesa que no hay suficiente oxígeno para todos y que la única esperanza para sobrevivir es la cámara criogénica que hay en el corazón de la nave. Sin embargo, esta solo puede albergar a un superviviente, por lo que da comienzo una lucha sangrienta por esconder este secreto al resto de las personas de la nave.
