La historia de Marvel Future Avengers sigue los pasos de Makoto, un joven que consigue superpoderes debido a un experimento de manipulación genética. Makoto y otros jóvenes se unen a los Avengers como aprendices bajo el nombre de «Future Avengers». Estos futuros héroes se entrenarán y lucharán contra villanos bajo la atenta mirada de los Vengadores Iron Man, Capitán América, Hulk, Thor y Wasp.
